濒危物种少女之所以下架,是因为出现了版权问题。这个故事主要讲述了一名叫做泉水子的少女在上学的过程中发生了一系列的搞笑故事,泉水子就是这个故事中所说的濒危物种少女,她从小就在一个神奇的神社中长大,因为很少和外界的人接触,而且她又个性害羞,所以从小到大她基本上没有任何朋友,也不会和别人交流。
不仅如此,她还有一个特异功能,那就是只要她碰到的电子产品必然损坏,在一个电子产品当道的时代里面,一个要远离电子产品的人注定会被别人孤立。当她想要离开自己生活的地方,到城市里居住的时候,她的监护人却建议她到学校就读,毕竟她不能一直过这样的生活。
这个提议给她的生活带来了很大的改变,因为监护人让自己的儿子和她一起同行,起初两个人相互厌恶,互相都看不惯对方的一些行为。泉水子因为自己的特异功能,所以不敢触碰深行身上的任何东西,深行也不喜欢这个奇怪的女生。
但是在他们毕业旅行的时候,一个奇怪的事件发生了,两个人不得不并肩面对即将到来的一切,关系也渐渐产生了变化。泉水子和深行两个人相爱了,但是由于她身上的特异功能,所以两个人必须要开始一段全新的旅途。