一般来说，未拆封的干海参只要放在干燥通风的地方就能长时间存放，因为海参的肉质已经干枯，外表还裹着一层盐，隔绝了空气。拆封的干海参比较容易受潮，最好是用密封袋或密封罐将海参封存起来后，再放到干燥通风的地方进行保存。为了防止影响其品质和口感，短期保持最好放到冷藏，长期保存最好放到冻藏，食用前再解冻。
干海参在存储得当的情况下，保质期一般在2-3年左右，一旦出现霉变和返潮现象，就证明海参已经变质。纯淡干海参表面没有隔绝水和空气的盐粒，最好不要与空气直接接触。
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